“做出指示”是错误的，只有“作出指示”。
凡是通过抽象行为实现的动作，用“作出”。一般地，其主词多为组织，其宾词往往富含更加具体的内容，所表述语义多是对他人提出要求，对为什么这样“作”有明确的目的。比如，“作出规定”、“作出选择”、“作出让步”、“作出战略部署”、“作出指示”、“作出决策”、“作出判断”、“作出处罚”等。
凡是通过具体行为实现的动作，用“做出”。一般地，其主词多为具体的人，其宾词没有更加具体的内容或者虽有但很难用语言具体描述，所表述语义一般不对他人提出要求，主观上不强调为什么这样“做”。比如“做出回答”、“做出贡献”、“做出成绩”、“做出榜样”等。