“墨子号”之名取自于我国科学家先贤，体现了我们的文化自信。哲学家、墨家学派创始人墨子也是一位鲜为人知的伟大科学家，《墨经》里记载了世界上第一个“小孔成像”实验，该实验解释了小孔成倒像的原因，而这正是现代照相技术原理的起源。
这个实验指出了光是沿着直线传播的，也是第一次对光直线传播进行科学解释——这在光学中是非常重要的一条原理，为量子通信的发展打下了一定的基础。取“墨子号”来命名量子卫星，和卫星本身的意义相符，也体现了我们的文化自信。
量子通信是目前人类唯一已知的无条件安全的通信方式，根据量子理论能解决通信安全的问题。我国发射的全球第一颗量子科学实验卫星，意味着将在世界上率先实践量子通信。