制度和机制的区别是：含义不同，出处不同。
一、含义不同
1、制度
释义：在一定历史条件下形成的法令、礼俗等规范；制订法规；规定；指规定品级的服饰；制作；制作方法；规模、样式；规制形状；指一定的规格或法令礼俗。
2、机制是指各要素之间的结构关系和运行方式；有机体的构造、功能及其相互关系；机器的构造和工作原理。
二、出处不同
1、制度
宋·王安石《取材》：“所谓诸生者，不独取训习句读而已，必也习典礼，明制度。”
《左传·襄公二十八年》：“且夫富，如布帛之有幅焉，为之制度，使无迁也。”
2、机制
清·丘逢甲《汕头海关歌寄伯瑶》：“西人嗜糖嗜其白，贱买赤砂改机制。”